Lidové umění
Mezi lidové umění řadíme kolekci lidových podmaleb na skle, které pocházejí většinou z 19. století a které jsou jednou z nejpočetnějších sbírek tohoto druhu v Čechách. Soubor nejvíce obsahuje podmalby mající původ v jednom z nejvýznamnějších míst jejich výroby, a sice Sandl - Pohoří. Dále sem patří malba na dřevě, různé plastiky, pouťové zboží, devocionálie, betlémy, hračky či formy na modrotisk a perník. Zvláště cenný je soubor tzv. Kneisslovy sbírky svatých obrázků čítající přes 2 400 kusů.
Pobočky
- Historická budova Jihočeského muzea
- Muzeum koněspřežky
- Tvrz Žumberk u Nových Hradů
- Památník Jana Žižky z Trocnova